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Cyt c模擬計算——復達客戶檢測案例

2021年07月09日，客服中心反饋廣東某大學的模擬需求，接到反饋后，材料檢測實驗室工程師第一時間與客戶進行詳細溝通，情況如下：


客戶背景


客戶是之前做過對結果很滿意，現又繼續跟進做了。需要得到精確的反應過程，第一是第一個雙氧水和鐵中心結合的能力算出來；第二是第二個雙氧水被遠離的His穩定的可能性。


樣品名稱


游離Cyt c和Cyt c@HOFs（最優結構）


客戶需求


需要得到精確的反應過程，第一是第一個雙氧水和鐵中心結合的能力算出來，第二是第二個雙氧水被遠離的His穩定的可能性。


解決方案


細胞色素c (Cyt c)蛋白與框架材料，利用大分子對接軟件，將蛋白質與框架材料進行分子對接，獲取兩者之間最低能量點對接位相，作為兩者動力學優化前提結構；長時間分子動力學：對蛋白-納米框架材料，進行>100ns的分子動力學模擬，直至體系平衡，取平衡后復合物體系平均結構。


客戶反饋


客戶對結果非常滿意，數據和圖都十分漂亮。


蛋白質與框架材料分子對接.png

納米材料對接格點盒子.png

蛋白質分子對接.png

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